环状RNA（circRNA）是一种共价封闭的单链RNA分子，它不包含帽子和聚腺苷酸（poly(A)）尾巴，且由于其降解动力学的改变，其转基因表达时间相较于线性mRNA更为持久。这些优势促使体外转录（IVT）circRNA正在迅速被开发用于疫苗、治疗遗传性疾病和调节免疫系统等治疗应用。云舟生物专注于各种规模的定制circRNA生产。
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云舟生物基于Ⅰ型内含子的PIE（Permuted Intron-Exon）系统，开发了可用于制备高产量、高纯度的环状RNA（circRNA）生产平台（图1）。通过这种机制生成的circRNA具有极少的杂质并最小化疤痕序列的存在。circRNA的翻译依赖于内部核糖体进入位点（IRES）。IRES招募核糖体在转录本的内部独立于其5’ 端启动翻译。
图1 体外circRNA自剪切机制。circRNA的翻译是IRES依赖的。
图2 EGFP IVT circRNA在HEK293T细胞中的表达效果。circRNA转染HEK293T细胞，对比mRNA具有更持久的表达效果。
| mRNA | circRNA | saRNA | |
| 结构 | 线性分子，通常包含5’ 帽子、5’ UTR、GOI的ORF、3’ UTR、以及poly(A)尾巴 | 环状分子，通常包含IRES元件和GOI的ORF | 线性分子，通常包含5’ 帽子、5’ UTR、复制酶和GOI的ORF、3’ UTR、以及poly(A)尾巴 |
| 帽子 | 需要5’ 帽子维持RNA稳定性并招募核糖体 | 没有帽子结构，采用IRES元件招募核糖体 | 需要5’ 帽子维持RNA稳定性并招募核糖体 |
| RNA长度（nt） | 100 ~ 10,000 | 1,000 ～ 5,000 | 7,000 ~ 10,000 |
| 稳定性 | 相对低 | 高 | 相对低 |
| 是否可以在生产时引入修饰核苷？ | 是 | 通常不添加修饰 | 是 |
| 表达水平 | 相对低 | 中 | 高 |
| 表达时长 | 相对短 | 中 | 长 |
| 免疫原性 | 相对低 | 中 | 高 |
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